Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIX1Q15475 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX1Q15475 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX1Q15475 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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