Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDK3Q15120 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDK3Q15120 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDK3Q15120 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
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