Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBR1Q14596 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBR1Q14596 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NBR1Q14596 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBR1Q14596 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBR1Q14596 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBR1Q14596 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBR1Q14596 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBR1Q14596 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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