Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
COL9A2Q14055 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL9A2Q14055 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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