Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRR1Q13601 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRR1Q13601 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KRR1Q13601 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRR1Q13601 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRR1Q13601 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRR1Q13601 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRR1Q13601 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRR1Q13601 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRR1Q13601 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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