Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-9■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.818e-12■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PTPRK-222ENST00000532751 563 ntTSL 421.48■■□□□ 1.035e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PFDN4-205ENST00000493356 659 ntTSL 321.46■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PTPRK-208ENST00000392449 1456 ntTSL 216.38■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 LSM14A-204ENST00000585887 445 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.063e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PFDN4-204ENST00000487129 762 ntTSL 214.96□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 LSM14A-205ENST00000586157 944 ntTSL 513.95□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.455e-6■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.515e-6■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 STAG3L5P-201ENST00000414292 517 ntTSL 211.77□□□□□ -0.535e-8■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 PTPRK-221ENST00000532331 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.725e-6■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-11■■■■□ 22.5
TRA2AQ13595 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.85e-6■■■■□ 22.5
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TRA2AQ13595 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.063e-6■■■■□ 22.1
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TRA2AQ13595 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.123e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.243e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.283e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 U2SURP-205ENST00000467348 1267 ntTSL 55.18□□□□□ -1.586e-7■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 RBM39-231ENST00000477334 949 ntTSL 23.63□□□□□ -1.833e-18■■■■□ 22.1
TRA2AQ13595 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.976e-7■■■■□ 22
TRA2AQ13595 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.94□□□□□ -1.946e-7■■■■□ 22
TRA2AQ13595 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)13.84□□□□□ -0.193e-9■■■■□ 22
TRA2AQ13595 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.219e-9■■■■□ 21.9
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