Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SF3B2Q13435 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SF3B2Q13435 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SF3B2Q13435 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SF3B2Q13435 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
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