Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BNIP1Q12981 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BNIP1Q12981 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BNIP1Q12981 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms