Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 PAN6YIL145C 930 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 VPS1YKR001C 2115 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 ATR1YML116W 1629 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 DBP9YLR276C 1785 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 ENT2YLR206W 1842 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 GIP1YBR045C 1920 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 RPS16BYDL083C 432 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 URA3YEL021W 804 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YLR296WYLR296W 327 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 UBA1YKL210W 3075 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 RPN5YDL147W 1338 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YMD8YML038C 1329 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 RPT1YKL145W 1404 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 ORC5YNL261W 1440 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YGR291CYGR291C 222 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 STE12YHR084W 2067 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 PMT2YAL023C 2280 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 OXP1YKL215C 3861 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 FAA4YMR246W 2085 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 MAL11YGR289C 1851 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 TBF1YPL128C 1689 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 MMR1YLR190W 1476 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 SLD2YKL108W 1362 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 CLP1YOR250C 1338 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 RAM1YDL090C 1296 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YDR154CYDR154C 351 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 CWC21YDR482C 408 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 HCR1YLR192C 798 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 SHP1YBL058W 1272 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 RPS15YOL040C 429 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 SNT2YGL131C 4212 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 DBF2YGR092W 1719 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 TNA1YGR260W 1605 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 GCR2YNL199C 1605 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 TRK2YKR050W 2670 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 YIL060WYIL060W 435 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 RHO3YIL118W 696 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 ENV9YOR246C 993 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN5Q12250 GAS3YMR215W 1575 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SHM1YBR263W 1473 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 ARB1YER036C 1833 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 BAP2YBR068C 1830 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 RSM10YDR041W 612 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SEN34YAR008W 828 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YNR048WYNR048W 1182 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 snR32snR32 188 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SFB3YHR098C 2790 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 CLA4YNL298W 2529 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YDL144CYDL144C 1071 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SEC13YLR208W 894 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 MAC1YMR021C 1254 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 OSW5YMR148W 447 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 RHO2YNL090W 579 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 RRT2YBR246W 1164 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 TAX4YJL083W 1815 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 MRE11YMR224C 2079 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SEC12YNR026C 1416 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 TOM40YMR203W 1164 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PSH1YOL054W 1221 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 CKA2YOR061W 1020 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 UTP7YER082C 1665 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PIF1YML061C 2580 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YJR124CYJR124C 1347 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 CBP4YGR174C 513 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PML1YLR016C 615 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 POR1YNL055C 852 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 TRP3YKL211C 1455 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 EPS1YIL005W 2106 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 UTP18YJL069C 1785 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 ASH1YKL185W 1767 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 GDB1YPR184W 4611 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 WTM1YOR230W 1314 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SIR2YDL042C 1689 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 SFC1YJR095W 969 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YKL223WYKL223W 333 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 RSA3YLR221C 663 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PGA3YML125C 939 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PDR16YNL231C 1056 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 RGT1YKL038W 3513 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 ACF2YLR144C 2340 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YIR043CYIR043C 693 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PHO86YJL117W 936 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YJL193WYJL193W 1209 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 HOR7YMR251W-A 180 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 OCA1YNL099C 717 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 NRM1YNR009W 750 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 PIN2YOR104W 849 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 YPR098CYPR098C 486 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 RET1YOR207C 3450 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 LPL1YOR059C 1353 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 TEF1YPR080W 1377 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 TEF2YBR118W 1377 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN5Q12250 HEM3YDL205C 984 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN5Q12250 IML2YJL082W 2196 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN5Q12250 MEC3YLR288C 1425 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN5Q12250 YTA12YMR089C 2478 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN5Q12250 LAP2YNL045W 2016 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN5Q12250 YPL102CYPL102C 303 nt5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms