Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 NOP7YGR103W 1818 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 PEX7YDR142C 1128 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 MRPL25YGR076C 474 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 IPI1YHR085W 1005 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 JJJ3YJR097W 519 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 YKL151CYKL151C 1014 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RPS15YOL040C 429 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 MED4YOR174W 855 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 ARR1YPR199C 885 nt5.65□□□□□ -1.5
LCB4Q12246 RTT106YNL206C 1368 nt5.65□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 BUL1YMR275C 2931 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 CTF18YMR078C 2226 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 PAT1YCR077C 2391 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 MID1YNL291C 1647 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 PTK2YJR059W 2457 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 RPT6YGL048C 1218 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 CDC11YJR076C 1248 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 PGU1YJR153W 1086 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 LDB18YLL049W 540 nt5.64□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 HXT15YDL245C 1704 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 HXT16YJR158W 1704 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YLR118CYLR118C 684 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 VTA1YLR181C 993 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 SEC13YLR208W 894 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 POS5YPL188W 1245 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 GUF1YLR289W 1938 nt5.63□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 AMA1YGR225W 1782 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 ADK2YER170W 678 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 SNZ3YFL059W 897 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YFL064CYFL064C 525 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 VMA16YHR026W 642 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 ADD66YKL206C 804 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 PML1YLR016C 615 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 PPA2YMR267W 933 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 SNZ2YNL333W 897 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YPR202WYPR202W 717 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 MST1YKL194C 1389 nt5.62□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 IMG2YCR071C 441 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YDL057WYDL057W 987 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 RPL7AYGL076C 735 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 BZZ1YHR114W 1902 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 GAT4YIR013C 366 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 TRK2YKR050W 2670 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 TFS1YLR178C 660 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 NMT1YLR195C 1368 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YLR283WYLR283W 945 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 MPC54YOR177C 1395 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 RPL7BYPL198W 735 nt5.61□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 KEX2YNL238W 2445 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 SOG2YOR353C 2376 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 MMR1YLR190W 1476 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 WTM1YOR230W 1314 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YDL023CYDL023C 321 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 SLO1YER180C-A 258 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 AAD6YFL056C 639 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.6□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YHR045WYHR045W 1683 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 GUA1YMR217W 1578 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YJR015WYJR015W 1533 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 MED2YDL005C 1296 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 RAM1YDL090C 1296 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 RTT103YDR289C 1230 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 ERG3YLR056W 1098 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 YOR318CYOR318C 306 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 KTR3YBR205W 1215 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 STL1YDR536W 1710 nt5.59□□□□□ -1.51
LCB4Q12246 QDR3YBR043C 2070 nt5.59□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 GYP1YOR070C 1914 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ADE13YLR359W 1449 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ATG7YHR171W 1893 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 TEF1YPR080W 1377 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 TEF2YBR118W 1377 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ECM7YLR443W 1347 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 YCL041CYCL041C 495 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ATP1YBL099W 1638 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 UGO1YDR470C 1509 nt5.58□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 CLB1YGR108W 1416 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 RPT1YKL145W 1404 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 YMR155WYMR155W 1644 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 PCL9YDL179W 915 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 KRE9YJL174W 831 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 TIF34YMR146C 1044 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 HSF1YGL073W 2502 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ATG32YIL146C 1590 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 SLX5YDL013W 1860 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ALT2YDR111C 1524 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 MSN2YMR037C 2115 nt5.57□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 HSP150YJL159W 1242 nt5.56□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 YLL017WYLL017W 312 nt5.56□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 YGP1YNL160W 1065 nt5.56□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 SSO1YPL232W 873 nt5.56□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 YGR182CYGR182C 354 nt5.55□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.55□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ALT1YLR089C 1779 nt5.55□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 HIR1YBL008W 2523 nt5.54□□□□□ -1.52
LCB4Q12246 ALD6YPL061W 1503 nt5.54□□□□□ -1.52
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