Protein–RNA interactions for Protein: Q12244

YLL054C, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YLL054C, yeastyeast

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL054CQ12244 YBR134WYBR134W 402 nt6.54□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 APA1YCL050C 966 nt6.54□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 VBA1YMR088C 1689 nt6.54□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 ERG7YHR072W 2196 nt6.54□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 YLR108CYLR108C 1458 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 YMR034CYMR034C 1305 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 BPL1YDL141W 2073 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 YDL119CYDL119C 924 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 TRS23YDR246W 660 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 IRC7YFR055W 1023 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 YGL102CYGL102C 429 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 YLL056CYLL056C 897 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 PEX13YLR191W 1161 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 URA5YML106W 681 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 YBL036CYBL036C 774 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 TGS1YPL157W 948 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 PAP2YOL115W 1755 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 CHS5YLR330W 2016 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 VRP1YLR337C 2454 nt6.53□□□□□ -1.36
YLL054CQ12244 snR63snR63 255 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 AIM33YML087C 939 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CPR8YNR028W 927 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YOL046CYOL046C 675 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 GRX5YPL059W 453 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YPR177CYPR177C 372 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 ADH5YBR145W 1056 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CMR1YDL156W 1569 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 SET5YHR207C 1581 nt6.52□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 OPT1YJL212C 2400 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 MCM6YGL201C 3054 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CRF1YDR223W 1404 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YGR273CYGR273C 525 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 RPB4YJL140W 666 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YJL144WYJL144W 315 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 GMH1YKR030W 822 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 MTF1YMR228W 1026 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PGA2YNL149C 390 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CPA1YOR303W 1236 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YOR342CYOR342C 960 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 SMX3YPR182W 261 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CST6YIL036W 1764 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YIR007WYIR007W 2295 nt6.51□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 SAD1YFR005C 1347 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YLR345WYLR345W 1530 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 COX15YER141W 1461 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PPH21YDL134C 1110 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CBS2YDR197W 1170 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PFA5YDR459C 1125 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PRI1YIR008C 1230 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 ECM1YAL059W 639 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 RPL31BYLR406C 342 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 BSC4YNL269W 396 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 REX4YOL080C 870 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 IPP1YBR011C 864 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YPL102CYPL102C 303 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 POC4YPL144W 447 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CLN2YPL256C 1638 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 UBP8YMR223W 1416 nt6.5□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 UPS3YDR185C 540 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 MRPS28YDR337W 861 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 AGX1YFL030W 1158 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 KRE9YJL174W 831 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YJR107WYJR107W 987 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YNL171CYNL171C 369 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 SFG1YOR315W 1041 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 ICP55YER078C 1536 nt6.49□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 JIP4YDR475C 2631 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 MIP1YOR330C 3765 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YDR282CYDR282C 1245 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 TRS31YDR472W 852 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 DID4YKL002W 699 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PSH1YOL054W 1221 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 NUP49YGL172W 1419 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PLB3YOL011W 2061 nt6.48□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PTC1YDL006W 846 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YDL177CYDL177C 513 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YDR042CYDR042C 603 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PAD1YDR538W 729 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 PEX14YGL153W 1026 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YGL262WYGL262W 528 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YHB1YGR234W 1200 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 SPO11YHL022C 1197 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 YJU2YKL095W 837 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 LDB7YBL006C 543 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 CUE4YML101C 354 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 ASR1YPR093C 867 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 EIS1YMR031C 2532 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 AAP1YHR047C 2571 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 OXP1YKL215C 3861 nt6.47□□□□□ -1.37
YLL054CQ12244 snR56snR56 88 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 STE2YFL026W 1296 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 GCN3YKR026C 918 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 BIO3YNR058W 1443 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 TMA46YOR091W 1038 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 ROG3YFR022W 2202 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 ECM3YOR092W 1842 nt6.46□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 MSC3YLR219W 2187 nt6.45□□□□□ -1.38
YLL054CQ12244 GPA2YER020W 1350 nt6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms