Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 SSP120YLR250W 705 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 RRT2YBR246W 1164 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 SEC12YNR026C 1416 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 TBF1YPL128C 1689 nt5.47□□□□□ -1.53
UBX3Q12229 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 EPS1YIL005W 2106 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 RSA3YLR221C 663 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 RHO2YNL090W 579 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 MRPL22YNL177C 930 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 PSH1YOL054W 1221 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 MRI1YPR118W 1236 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 ASH1YKL185W 1767 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 UTP7YER082C 1665 nt5.46□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YDL119CYDL119C 924 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 SRG1SRG1 551 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YGR022CYGR022C 330 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 EGD2YHR193C 525 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 KRE9YJL174W 831 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 MRP17YKL003C 396 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 MTQ1YNL063W 945 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YPR098CYPR098C 486 nt5.45□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 CBP4YGR174C 513 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YIL060WYIL060W 435 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YOR200WYOR200W 399 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 SFB3YHR098C 2790 nt5.44□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 VHT1YGR065C 1782 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 COX26YDR119W-A 201 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 IPK1YDR315C 846 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 MPC1YGL080W 393 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YKL107WYKL107W 930 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 PEX12YMR026C 1200 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YMR114CYMR114C 1107 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 PIN2YOR104W 849 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 CTS2YDR371W 1536 nt5.43□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 TEF1YPR080W 1377 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 TEF2YBR118W 1377 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YBR138CYBR138C 1575 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 DCN1YLR128W 810 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YBL044WYBL044W 369 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 POR1YNL055C 852 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YNL228WYNL228W 777 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 SCT1YBL011W 2280 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 UBX2YML013W 1755 nt5.42□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 TNA1YGR260W 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 RPT1YKL145W 1404 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YFL034WYFL034W 3222 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 PDE1YGL248W 1110 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 Q0144Q0144 330 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 PRP40YKL012W 1752 nt5.41□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 UTP18YJL069C 1785 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YDL034WYDL034W 345 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 SUA5YGL169W 1281 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 ISY1YJR050W 708 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 UBC4YBR082C 447 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.4□□□□□ -1.54
UBX3Q12229 SRV2YNL138W 1581 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 RAT1YOR048C 3021 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 HXT3YDR345C 1704 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 SVF1YDR346C 1446 nt5.4□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 HFI1YPL254W 1467 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 NUD1YOR373W 2556 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 TUL1YKL034W 2277 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 PDH1YPR002W 1551 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 YDR541CYDR541C 1035 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 YHR095WYHR095W 495 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 SCP1YOR367W 603 nt5.39□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 SAC6YDR129C 1929 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 ABZ1YNR033W 2364 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 DED81YHR019C 1665 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 MTQ2YDR140W 666 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 EAF5YEL018W 840 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 SYF2YGR129W 648 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 YJR115WYJR115W 510 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 COS9YKL219W 1224 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 MTF2YDL044C 1323 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 TRP3YKL211C 1455 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 GSY2YLR258W 2118 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 CDC19YAL038W 1503 nt5.38□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 VAN1YML115C 1608 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 VPS70YJR126C 2436 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 HEM3YDL205C 984 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 CAD1YDR423C 1230 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 MMS2YGL087C 414 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 YGR176WYGR176W 348 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 MAD2YJL030W 591 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 HOR7YMR251W-A 180 nt5.37□□□□□ -1.55
UBX3Q12229 PGA2YNL149C 390 nt5.37□□□□□ -1.55
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