Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 MLC2YPR188C 492 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 snR32snR32 188 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 BNA5YLR231C 1362 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PIF1YML061C 2580 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 DDC1YPL194W 1839 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 VMS1YDR049W 1899 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 HFI1YPL254W 1467 nt5.39□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YML082WYML082W 1950 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 OCA5YHL029C 2040 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 BUD14YAR014C 2130 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 HXT3YDR345C 1704 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 ENV9YOR246C 993 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 CSG2YBR036C 1233 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YPL062WYPL062W 405 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 CBC2YPL178W 627 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 SPS22YCL048W 1392 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 CMR1YDL156W 1569 nt5.38□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 CAD1YDR423C 1230 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PGA2YNL149C 390 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 MDY2YOL111C 639 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 SAM4YPL273W 978 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 NOP2YNL061W 1857 nt5.37□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YNL095CYNL095C 1929 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YER187WYER187W 426 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 NRM1YNR009W 750 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 SSZ1YHR064C 1617 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 BIT2YBR270C 1638 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 NDC1YML031W 1968 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 GRS1YBR121C 2004 nt5.36□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 RSC2YLR357W 2670 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PHO90YJL198W 2646 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PMT2YAL023C 2280 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 MMP1YLL061W 1752 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PWP1YLR196W 1731 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 VHS1YDR247W 1386 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 GET3YDL100C 1065 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PHM8YER037W 966 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PDR16YNL231C 1056 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 EXO1YOR033C 2109 nt5.35□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 DPH2YKL191W 1605 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 ATO3YDR384C 828 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 PRO3YER023W 861 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 ACS2YLR153C 2052 nt5.34□□□□□ -1.55
RPN8Q08723 ELP3YPL086C 1674 nt5.34□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 CHS5YLR330W 2016 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YBL044WYBL044W 369 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YOR318CYOR318C 306 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 VNX1YNL321W 2727 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 VAN1YML115C 1608 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 RAD53YPL153C 2466 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 ATE1YGL017W 1512 nt5.33□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 NQM1YGR043C 1002 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YNL296WYNL296W 315 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 PPR1YLR014C 2715 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 SLT2YHR030C 1455 nt5.32□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 FOB1YDR110W 1701 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 UTP9YHR196W 1728 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 RBA50YDR527W 1320 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 GLO2YDR272W 825 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 RPT6YGL048C 1218 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YLR283WYLR283W 945 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 REC114YMR133W 1287 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 SEC17YBL050W 879 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 MTQ1YNL063W 945 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 CAM1YPL048W 1248 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 DNF2YDR093W 4839 nt5.31□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 TRK2YKR050W 2670 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 DAK1YML070W 1755 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 BUL1YMR275C 2931 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 POM33YLL023C 840 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 SNT2YGL131C 4212 nt5.3□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 ELP2YGR200C 2367 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 UBP9YER098W 2265 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 ATP14YLR295C 375 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 PGA3YML125C 939 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 snR10snR10 245 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 PDB1YBR221C 1101 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 BAP2YBR068C 1830 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 MCX1YBR227C 1563 nt5.29□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 UGO1YDR470C 1509 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YDL023CYDL023C 321 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 YKR041WYKR041W 753 nt5.28□□□□□ -1.56
RPN8Q08723 VID30YGL227W 2877 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 CYK3YDL117W 2658 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 YDL034WYDL034W 345 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 CDC43YGL155W 1131 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.27□□□□□ -1.57
RPN8Q08723 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms