Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NHLH2Q02577 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NHLH2Q02577 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NHLH2Q02577 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms