Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLCB3Q01970 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLCB3Q01970 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms