Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DEFA5Q01523 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DEFA5Q01523 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms