Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITPNAQ00169 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITPNAQ00169 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms