Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMAD3P84022 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMAD3P84022 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms