Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
IRX6P78412 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRX6P78412 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRX6P78412 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRX6P78412 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IRX6P78412 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IRX6P78412 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
IRX6P78412 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IRX6P78412 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRX6P78412 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRX6P78412 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IRX6P78412 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX6P78412 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX6P78412 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX6P78412 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX6P78412 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX6P78412 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IRX6P78412 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IRX6P78412 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IRX6P78412 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IRX6P78412 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX6P78412 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
IRX6P78412 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
IRX6P78412 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX6P78412 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX6P78412 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX6P78412 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX6P78412 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
IRX6P78412 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IRX6P78412 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IRX6P78412 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms