Protein–RNA interactions for Protein: P78368

CSNK1G2, Casein kinase I isoform gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2P78368 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSNK1G2P78368 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSNK1G2P78368 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSNK1G2P78368 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms