Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVK-21P61565 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVK-21P61565 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVK-21P61565 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms