Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
ROMO1P60602 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
ROMO1P60602 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms