Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RHBDL3P58872 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHBDL3P58872 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHBDL3P58872 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms