Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NAP1L1P55209 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NAP1L1P55209 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NAP1L1P55209 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms