Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ELLP55199 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ELLP55199 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ELLP55199 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ELLP55199 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELLP55199 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELLP55199 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELLP55199 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ELLP55199 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ELLP55199 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELLP55199 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELLP55199 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ELLP55199 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELLP55199 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ELLP55199 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ELLP55199 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ELLP55199 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ELLP55199 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ELLP55199 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms