Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AQP4P55087 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AQP4P55087 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AQP4P55087 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AQP4P55087 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AQP4P55087 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AQP4P55087 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AQP4P55087 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AQP4P55087 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AQP4P55087 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AQP4P55087 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AQP4P55087 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AQP4P55087 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AQP4P55087 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AQP4P55087 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AQP4P55087 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AQP4P55087 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AQP4P55087 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AQP4P55087 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AQP4P55087 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AQP4P55087 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AQP4P55087 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AQP4P55087 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AQP4P55087 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AQP4P55087 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AQP4P55087 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AQP4P55087 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms