Protein–RNA interactions for Protein: P43489

TNFRSF4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF4P43489 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF4P43489 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF4P43489 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF4P43489 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms