Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTGER3P43115 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PTGER3P43115 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER3P43115 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms