Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFSF9P41273 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFSF9P41273 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFSF9P41273 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms