Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCGF2P35227 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PCGF2P35227 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCGF2P35227 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms