Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSP1P33241 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSP1P33241 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LSP1P33241 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSP1P33241 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSP1P33241 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSP1P33241 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSP1P33241 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSP1P33241 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSP1P33241 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSP1P33241 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSP1P33241 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSP1P33241 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSP1P33241 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSP1P33241 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSP1P33241 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSP1P33241 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LSP1P33241 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSP1P33241 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSP1P33241 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSP1P33241 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSP1P33241 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LSP1P33241 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms