Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD1CP29017 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD1CP29017 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD1CP29017 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD1CP29017 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD1CP29017 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD1CP29017 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD1CP29017 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD1CP29017 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD1CP29017 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD1CP29017 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD1CP29017 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1CP29017 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1CP29017 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1CP29017 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1CP29017 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1CP29017 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD1CP29017 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD1CP29017 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD1CP29017 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD1CP29017 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1CP29017 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1CP29017 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1CP29017 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1CP29017 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD1CP29017 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD1CP29017 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1CP29017 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1CP29017 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1CP29017 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1CP29017 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD1CP29017 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD1CP29017 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD1CP29017 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD1CP29017 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD1CP29017 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD1CP29017 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms