Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRMP28827 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRMP28827 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRMP28827 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms