Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR2P28476 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRR2P28476 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR2P28476 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms