Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLD1P28340 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLD1P28340 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLD1P28340 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLD1P28340 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLD1P28340 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLD1P28340 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLD1P28340 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLD1P28340 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLD1P28340 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLD1P28340 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
POLD1P28340 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLD1P28340 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLD1P28340 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLD1P28340 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
POLD1P28340 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
POLD1P28340 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLD1P28340 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLD1P28340 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLD1P28340 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLD1P28340 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
POLD1P28340 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLD1P28340 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLD1P28340 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLD1P28340 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
POLD1P28340 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLD1P28340 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
POLD1P28340 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLD1P28340 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLD1P28340 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLD1P28340 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
POLD1P28340 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLD1P28340 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
POLD1P28340 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLD1P28340 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLD1P28340 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLD1P28340 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLD1P28340 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLD1P28340 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLD1P28340 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLD1P28340 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLD1P28340 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLD1P28340 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLD1P28340 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLD1P28340 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLD1P28340 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms