Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GADD45AP24522 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GADD45AP24522 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GADD45AP24522 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms