Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRHP20396 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRHP20396 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRHP20396 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRHP20396 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TRHP20396 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRHP20396 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
TRHP20396 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRHP20396 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRHP20396 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRHP20396 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TRHP20396 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRHP20396 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRHP20396 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TRHP20396 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRHP20396 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRHP20396 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRHP20396 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRHP20396 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRHP20396 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRHP20396 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRHP20396 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TRHP20396 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRHP20396 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRHP20396 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TRHP20396 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRHP20396 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRHP20396 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRHP20396 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRHP20396 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
TRHP20396 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRHP20396 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRHP20396 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
TRHP20396 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRHP20396 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRHP20396 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRHP20396 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRHP20396 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRHP20396 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRHP20396 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRHP20396 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRHP20396 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
TRHP20396 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRHP20396 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRHP20396 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRHP20396 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TRHP20396 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
TRHP20396 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRHP20396 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
TRHP20396 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRHP20396 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRHP20396 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
TRHP20396 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
TRHP20396 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRHP20396 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRHP20396 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRHP20396 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRHP20396 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRHP20396 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRHP20396 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRHP20396 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRHP20396 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRHP20396 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TRHP20396 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRHP20396 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TRHP20396 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRHP20396 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
TRHP20396 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRHP20396 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRHP20396 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TRHP20396 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
TRHP20396 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRHP20396 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRHP20396 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRHP20396 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRHP20396 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRHP20396 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRHP20396 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
TRHP20396 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRHP20396 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRHP20396 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
TRHP20396 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms