Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LBPP18428 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LBPP18428 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LBPP18428 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LBPP18428 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBPP18428 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBPP18428 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBPP18428 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBPP18428 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBPP18428 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LBPP18428 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBPP18428 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBPP18428 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBPP18428 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LBPP18428 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LBPP18428 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LBPP18428 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LBPP18428 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBPP18428 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBPP18428 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBPP18428 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBPP18428 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LBPP18428 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LBPP18428 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBPP18428 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBPP18428 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBPP18428 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LBPP18428 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LBPP18428 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBPP18428 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LBPP18428 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LBPP18428 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms