Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXB9P17482 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXB9P17482 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB9P17482 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms