Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GATA1P15976 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GATA1P15976 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GATA1P15976 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GATA1P15976 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA1P15976 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA1P15976 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA1P15976 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GATA1P15976 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA1P15976 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA1P15976 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA1P15976 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA1P15976 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA1P15976 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GATA1P15976 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GATA1P15976 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GATA1P15976 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GATA1P15976 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA1P15976 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA1P15976 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GATA1P15976 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms