Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LYL1P12980 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYL1P12980 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYL1P12980 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYL1P12980 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LYL1P12980 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LYL1P12980 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LYL1P12980 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LYL1P12980 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LYL1P12980 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYL1P12980 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LYL1P12980 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LYL1P12980 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LYL1P12980 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LYL1P12980 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYL1P12980 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYL1P12980 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms