Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SKIP12755 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SKIP12755 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SKIP12755 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIP12755 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIP12755 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIP12755 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIP12755 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SKIP12755 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SKIP12755 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SKIP12755 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SKIP12755 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKIP12755 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKIP12755 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIP12755 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIP12755 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIP12755 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SKIP12755 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKIP12755 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SKIP12755 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKIP12755 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIP12755 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIP12755 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIP12755 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIP12755 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIP12755 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKIP12755 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKIP12755 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKIP12755 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIP12755 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIP12755 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIP12755 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIP12755 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKIP12755 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIP12755 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKIP12755 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SKIP12755 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms