Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf89P0DMQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf89P0DMQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf89P0DMQ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C8orf89P0DMQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C8orf89P0DMQ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf89P0DMQ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms