Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZIC2O95409 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZIC2O95409 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms