Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYNGR2O43760 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SYNGR2O43760 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms