Protein–RNA interactions for Protein: O43709

BUD23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23O43709 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BUD23O43709 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BUD23O43709 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BUD23O43709 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BUD23O43709 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BUD23O43709 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BUD23O43709 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BUD23O43709 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BUD23O43709 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BUD23O43709 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BUD23O43709 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BUD23O43709 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BUD23O43709 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BUD23O43709 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
BUD23O43709 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BUD23O43709 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BUD23O43709 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BUD23O43709 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BUD23O43709 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms