Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOCS3O14543 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOCS3O14543 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOCS3O14543 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms