Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BHLHE40O14503 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BHLHE40O14503 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BHLHE40O14503 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms