Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EBAG9O00559 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EBAG9O00559 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms