Protein–RNA interactions for Protein: H3BSA7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSA7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H3BSA7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BSA7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BSA7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BSA7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BSA7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
H3BSA7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H3BSA7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H3BSA7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H3BSA7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H3BSA7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H3BSA7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H3BSA7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H3BSA7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H3BSA7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H3BSA7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H3BSA7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms